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日本《经济新闻》等媒体2012年11月1日报道称，DNA分析证实现代日本人是由日本诸岛的土著居民绳文人和从朝鲜半岛远渡而来的弥生人不断混血传承的。

学术界通常的说法是，大约从新石器时代日本岛才开始有居民，最早的日本居民是从北方大陆移来的通古斯人，以后有马来人从南方渡海而来，大约从公元前一千纪后半开始，就不断有中国和朝鲜人移居日本。从新石器时代开始到公元前2世纪的日本，考古学上称为绳纹式文化时代，使用石器、骨器，捕猎、捕鱼，居住在竖穴中，出土有女性土偶。